質問者さん
いつも勉強させていただいております。私は病院の薬剤師で、薬剤の副作用等に関して自院の電子カルテベースの研究をしています。日本人である薬剤の急性腎障害を予測するモデルを自院の電子カルテから抽出したデータで作成し、現在論文投稿中です。次の研究として、このモデルの外的妥当性や一般化可能性を検討するため、JMDCのようなデータベースを使った研究が出来ないか考えておりますが、データベース研究のノウハウを持った人が周囲におらず、右も左もわかりません。そこで先生にご質問なのですが、①このようなデータベース研究に関して生物統計家にコンサルトする場合、依頼者側にはどの程度統計学の知識が求められますでしょうか？ ②ゼロからデータベース研究を立ち上がる場合、データベース利用料やコンサルト料含めて、どれくらいの金額がかかるものでしょうか？詳細はケースバイケースかと思いますが、おおよそ目安となる金額が分かりますと幸いです。よろしくお願いいたします。
07月04日
Sato Shuntaro｜佐藤俊太朗さん
ありがとうございます．①平均？割合？と言われると厳しいものはありますが，その研究が好きで，かつ自分で考えられることは考える，調べることは調べることができるならば，現時点での知識は関係ないと思います．一点，DB研究における統計疫学（特にこの例ですと薬剤疫学）の知識と一般的な生物統計の知識は別と考えてください．具体的にいうと，ぼくには一般的な生物統計の知識はありますが，DBをいかした検討は苦手です．②データベース利用料はわかりません．ベンダーによると思います．コンサルト料は持っている研究費や関係性等によるのでなんとも言えないです．とりあえず連絡するのが良いと思います．
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Sato Shuntaro｜佐藤俊太朗
生物統計学／疫学の方法論／長崎大学／ 医学系研究のデザインや統計のコンサルが得意です。 共同研究等やお仕事依頼はDMください。 現代疫学（監訳、学術図書出版社）。コメントは個人の見解で組織を代表するものではないです。 質問箱：https://querie.me/user/Shuntarooo31
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Sato Shuntaro｜佐藤俊太朗さんが
回答したTips質問
06月23日
いつもツイート拝見しております。先日の生存時間解析の講義も非常に面白かったです。当方、claim database を用いた臨床研究を行っており、研究のレベルを
一段上げたく、Target trial emulationの実装を試みており、Rでの実装を教えていただきたいです。Control群が「治療なし」の場合を考え、cloning、weighting、censoring を行おうと考えています。
請求データベースを用いて、入院から二日以内に治療を受けた患者をtreatment群に、受けなかった患者をcontrol群にassignし、入院から30日までフォローすると仮定します。アウトカムを死亡とし、hazard ratioとrisk differenceを推定したいです。この場合、一人一日一行でデータセットを作った方が良いのでしょうか？例えば1000人のコホートであれば1000人x30日xクローンで最大6万行のデータセットになりますでしょうか？その上でday1に治療を受ける確率、打ち切りになる確率、day2に治療を受ける確率、打ち切りになる確率、day3以降に打ち切りになる確率を30日分全て求めて日毎にアウトカムを発生する割合を比較するという形になりますか？またその場合、アウトカムの推定モデルはどういった物になりますでしょうか？単純なcoxph を用いて良いような形のデータには思えず、、。実際的なデータハンドリングのステップとhazard ratio及びrisk differenceを推定するための考え方、コードを教えていただけますと幸いです。
宜しくお願いいたします。
¥2,000
10月01日
いつも素晴らしいご発信ありがとうございます。ランダム化の具体的な方法を教えて頂きたくご質問しました。仮の話として,私が現在取り組んでいる研究(ClusterRCT)では1時点で、6のクラスターを2つと4つに層別化した上で層別ランダム化する段階にあります。多くの場合ランダム化はRedcapで行うことがある様子ですが、予算の関係でできればより少ない費用でランダム化を行いたいと考えています。何かランダム化行うアプリや他の具体的方法をご存知でしょうか？🙇♂️
何卒お教え頂けますと幸いです🙇♂️
10月01日
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ご回答誠にありがとうございます。説明が足らず申し訳ありませんでした。だいぶ少ないのですが、研究参加する全クラスター(自治体等)数が6つで、人口規模を層別因子として、人口規模の大きな2つの自治体と、より小さな人口規模の4つの自治体に層別したうえで、各層内でランダム化を行うことを想定した上でのご質問でした🙇♂️
Sato Shuntaro｜佐藤俊太朗さんが
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08月05日
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本当にありがとうございます。先生からのお言葉を胸に刻んでコツコツ頑張ります！
mMEDICI様主催のサマーセミナーも参加させていただきます。宜しくお願い致します。
¥1,000
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06月26日
いつも勉強させていただいております。以前に重回帰の変数の正規性と残差についてご質問致しました。この度、論文がAcceptされ、IF4.8の国際誌に掲載されました。先生にご教授いただき解析を進めることができたため、改めてお礼申し上げます。今後先生の益々のご活躍をお祈り申し上げます。
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06月24日
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非常に勉強になりました。誠にありがとうございます。研究費を獲得して、かつ佐藤先生に面白いと言って頂けるような研究を目指します。
Sato Shuntaro｜佐藤俊太朗さんが
最近答えた質問
10月02日
時系列のデータが2つある時、その2つが類似した傾向を辿ってるということを、示すことって統計で出来るんですか？
各観測場所で差がないことを示すくらいしかないんじゃないかなーとふと考えていたのですが、先生はどう思いますか？
10月02日
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「連続でなく離散にするメリットが私にはわからないです．」 連続か？離散か？って、どんな場面で？解釈だけですよね？ 「どう思うか？」それだけですよね。 プログラミングの変数には連続型とか離散型はないですよね。int型もdouble型も離散ですよ。
10月01日
例えば体重のことを連続量や連続変数などと言ったりしますが、例えば1kg刻みで30kgから130kgまでの間なら100段階の離散型の評価尺度でしかないですよね。100段階評価の心理学尺度と同じ扱いなはずです。それが、1g刻みなら100,000段階の離散型の評価尺度なだけで。医療統計では、連続変数は存在せず、全て離散尺度ですよね？？？
Sato Shuntaro｜佐藤俊太朗さんの
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2023年01月02日
続き質問
いつもツイート拝見させていただいております。基礎からしっかりトレーニングするために久留米大学のバイオ統計学群への進学を考えているのですが、先生はここの研究室にどのような印象をお持ちですか？よろしければお伺いしたいです。
2023年03月15日
いつも勉強させていただきありがとうございます。
Interrupted time series designを用いて、例えば男女のような群間で、曝露前の傾向と比較した曝露後の傾向の変化の群間比較や、曝露直後のレベルの変化の群間比較を行うことは可能でしょうか。
もし比較可能な場合、参考となるご存知の文献がありましたら教えていただけないでしょうか。
2023年05月30日
多重代入法で欠損処理をするタイミングは、除外基準でexcludeする前の参加者全てに対してか、それともexcludeした後の解析対象か、どちらでしょうか？